Le famosissime mystery box ci hanno accompagnato in tutti questi anni nei vari titoli di Super Mario, regalandoci la maggior parte delle volte monete e power up.
In Super Mario Maker avremo davvero tantissime possibilità, tra cui quella di decidere cosa inserire nei misteriosi cubi gialli con il punto interrogativo. A mostrarcele è Nintendo stessa con un nuovo video giapponese in cui, con molta ironia, viene mostrato come nei mystery box potremo inserire non solo power up e monete ma anche nemici, a parte il povero Bowser che, verosimilmente, è troppo ingombrante.